Annelies studeerde in 2004 af als leerkracht lager onderwijs en gaf de volgende 6 jaren ook les in het lager onderwijs. In 2009 behaalde ze haar masterdiploma Opleidings- en onderwijswetenschappen. Kort daarop maakte ze de overstap naar Algemeen onderwijsbeleid van de stad Antwerpen, nu gekend als onderwijsnetwerk Antwerpen waar ze meewerkte aan het project Samen tot aan de meet: alternatieven voor zittenblijven.
Sinds januari 2014 werkt Annelies Aerts als lerarenopleider, stagecoördinator en onderzoeker in de lerarenopleidingen kleuter- en lager onderwijs van AP.